Phương pháp thực nghiệm khoa học là phương pháp chủ động tác động vào đối tượng nghiên cứu và những hoạt động của đối tượng đó nhằm kiểm soát sự phát triển của chúng một cách có chủ đích.

Phương pháp này có thể thực hiện ở ngoài thực địa hoặc trong phòng thí nghiệm với các điều kiện môi trường được kiểm soát một cách chặt chẽ.

Các bước thực hiện:

Ví dụ: Điều tra sự phân bố của loài rết ở vườn quốc gia Cúc Phương; Đánh giá ảnh hưởng của nhiệt độ đến sự ra hoa của thanh long.

Một số phương pháp nghiên cứu thực nghiệm: